Conan Edogawa está enfrentando um dilema: Ran Mouri convidou Shinichi Kudou para ir ao cinema e ele não consegue dar uma desculpa convincente para não ir. No entanto, quando chega o dia do encontro, ele tem problemas mais urgentes com os quais se preocupar - uma grande quantidade de explosivos plásticos foi roubada recentemente e o culpado desafiou Shinichi a encontrar e descartar as bombas que ele espalhou pela cidade. Agora, forçado a correr contra o tempo, Conan deve não apenas proteger a cidade, mas também descobrir quem é o mentor e o motivo de seu confronto com Shinichi.
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